Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRSAM1Q6UWE0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRSAM1Q6UWE0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LRSAM1Q6UWE0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms