Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC6Q16204 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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