Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RYR3Q15413 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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