Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL1Q13616 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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