Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3FQ13275 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3FQ13275 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3FQ13275 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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