Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCPP55072 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPP55072 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPP55072 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPP55072 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPP55072 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPP55072 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPP55072 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCPP55072 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCPP55072 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCPP55072 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCPP55072 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VCPP55072 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCPP55072 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VCPP55072 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCPP55072 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCPP55072 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPP55072 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPP55072 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPP55072 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPP55072 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPP55072 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPP55072 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPP55072 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPP55072 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCPP55072 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCPP55072 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCPP55072 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VCPP55072 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VCPP55072 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VCPP55072 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCPP55072 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPP55072 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPP55072 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPP55072 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPP55072 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPP55072 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPP55072 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPP55072 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPP55072 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPP55072 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPP55072 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPP55072 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPP55072 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPP55072 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPP55072 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCPP55072 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCPP55072 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCPP55072 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCPP55072 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCPP55072 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCPP55072 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPP55072 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPP55072 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPP55072 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPP55072 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPP55072 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPP55072 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPP55072 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPP55072 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPP55072 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPP55072 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPP55072 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPP55072 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPP55072 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPP55072 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPP55072 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPP55072 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPP55072 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPP55072 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPP55072 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPP55072 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPP55072 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPP55072 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPP55072 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPP55072 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPP55072 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPP55072 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPP55072 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPP55072 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPP55072 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPP55072 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms