Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	ENT2	YLR206W	1842 nt		5.69	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	GPA1	YHR005C	1419 nt		5.68	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	COX26	YDR119W-A	201 nt		5.68	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	TFS1	YLR178C	660 nt		5.68	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YLR194C	YLR194C	765 nt		5.68	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	SEC13	YLR208W	894 nt		5.68	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	RTT106	YNL206C	1368 nt		5.67	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YGR182C	YGR182C	354 nt		5.67	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YJR115W	YJR115W	510 nt		5.67	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	ERG3	YLR056W	1098 nt		5.67	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YLL059C	YLL059C	507 nt		5.66	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YLR317W	YLR317W	435 nt		5.66	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YCL041C	YCL041C	495 nt		5.66	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YJR015W	YJR015W	1533 nt		5.65	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	ERI1	YPL096C-A	207 nt		5.65	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	GAA1	YLR088W	1845 nt		5.64	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	VID30	YGL227W	2877 nt		5.64	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	CAD1	YDR423C	1230 nt		5.64	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	PRO3	YER023W	861 nt		5.64	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	SNZ3	YFL059W	897 nt		5.64	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	SNZ2	YNL333W	897 nt		5.64	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	SSK1	YLR006C	2139 nt		5.63	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	VHT1	YGR065C	1782 nt		5.63	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	SNU71	YGR013W	1863 nt		5.63	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	MHR1	YDR296W	681 nt		5.63	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	SLO1	YER180C-A	258 nt		5.63	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	SFC1	YJR095W	969 nt		5.63	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	YOL097W-A	YOL097W-A	186 nt		5.63	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	YDL034W	YDL034W	345 nt		5.62	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	SIP2	YGL208W	1248 nt		5.62	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	PRM10	YJL108C	1152 nt		5.62	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	ATP4	YPL078C	735 nt		5.62	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	SSO1	YPL232W	873 nt		5.62	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	TBF1	YPL128C	1689 nt		5.62	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	RPT6	YGL048C	1218 nt		5.61	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	YGL194C-A	YGL194C-A	243 nt		5.61	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	DAL4	YIR028W	1908 nt		5.61	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	COS9	YKL219W	1224 nt		5.61	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	PGA3	YML125C	939 nt		5.61	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	RRT2	YBR246W	1164 nt		5.61	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	EPS1	YIL005W	2106 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)C	tN(GUU)C	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)F	tN(GUU)F	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)G	tN(GUU)G	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)K	tN(GUU)K	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)L	tN(GUU)L	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)N1	tN(GUU)N1	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)N2	tN(GUU)N2	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)O1	tN(GUU)O1	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)O2	tN(GUU)O2	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	tN(GUU)P	tN(GUU)P	74 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	KTR3	YBR205W	1215 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	STL1	YDR536W	1710 nt		5.6	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	JIP4	YDR475C	2631 nt		5.59	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	POP1	YNL221C	2628 nt		5.59	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	MAK32	YCR019W	1092 nt		5.59	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	PSH1	YOL054W	1221 nt		5.59	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	CBC2	YPL178W	627 nt		5.59	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	AIM3	YBR108W	2844 nt		5.59	□□□□□ -1.51
ATG12	P38316	NSE5	YML023C	1671 nt		5.59	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	SFB3	YHR098C	2790 nt		5.59	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	TNA1	YGR260W	1605 nt		5.59	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	TRK2	YKR050W	2670 nt		5.59	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	BUL1	YMR275C	2931 nt		5.58	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	NOB1	YOR056C	1380 nt		5.58	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	RET1	YOR207C	3450 nt		5.58	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	RHO2	YNL090W	579 nt		5.58	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	RPS15	YOL040C	429 nt		5.58	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	YOR318C	YOR318C	306 nt		5.58	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	ATF1	YOR377W	1578 nt		5.58	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	GEX1	YCL073C	1848 nt		5.58	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	GEX2	YKR106W	1848 nt		5.58	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	YLR283W	YLR283W	945 nt		5.57	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	ALT1	YLR089C	1779 nt		5.57	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	MCM6	YGL201C	3054 nt		5.56	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	RRP46	YGR095C	672 nt		5.56	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	YGR127W	YGR127W	939 nt		5.56	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	FAF1	YIL019W	1041 nt		5.56	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	SAM4	YPL273W	978 nt		5.56	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	YPR098C	YPR098C	486 nt		5.56	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	ASH1	YKL185W	1767 nt		5.56	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	SHE10	YGL228W	1734 nt		5.56	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	GET3	YDL100C	1065 nt		5.55	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	POR1	YNL055C	852 nt		5.55	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	MMP1	YLL061W	1752 nt		5.55	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	GSY2	YLR258W	2118 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	BZZ1	YHR114W	1902 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	UGO1	YDR470C	1509 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	VPS70	YJR126C	2436 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	TRP3	YKL211C	1455 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	YPL277C	YPL277C	1464 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	BAP2	YBR068C	1830 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	SCW4	YGR279C	1161 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	RMA1	YKL132C	1293 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	NDC1	YML031W	1968 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	SAC6	YDR129C	1929 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	GDA1	YEL042W	1557 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	TEF1	YPR080W	1377 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	TEF2	YBR118W	1377 nt		5.54	□□□□□ -1.52
ATG12	P38316	PIF1	YML061C	2580 nt		5.53	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 215.9 ms