Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1C1P21283 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1C1P21283 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms