Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC159P0C7I6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms