Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	YME1	YPR024W	2244 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	STE20	YHL007C	2820 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	YDR015C	YDR015C	240 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	MSP1	YGR028W	1089 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	ADE13	YLR359W	1449 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	RET1	YOR207C	3450 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	GAT1	YFL021W	1533 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	ATG4	YNL223W	1485 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YIL067C	YIL067C	2037 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	PEX19	YDL065C	1029 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	RPN11	YFR004W	921 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YHR213W-A	YHR213W-A	234 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YPL136W	YPL136W	369 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	GUA1	YMR217W	1578 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	ICL1	YER065C	1674 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	SNF3	YDL194W	2655 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	CAX4	YGR036C	720 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YJU3	YKL094W	942 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	DRE2	YKR071C	1047 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	RPL10	YLR075W	666 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YMR295C	YMR295C	594 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	PPG1	YNR032W	1107 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	RRP9	YPR137W	1722 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	EEB1	YPL095C	1371 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	TOS3	YGL179C	1683 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	AFT1	YGL071W	2073 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	ASH1	YKL185W	1767 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	FRE3	YOR381W	2136 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	RAD3	YER171W	2337 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YDL218W	YDL218W	954 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YER084W	YER084W	387 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	HAP2	YGL237C	798 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YIR020W-A	YIR020W-A	243 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	RFA1	YAR007C	1866 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	KCH1	YJR054W	1494 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	ASF2	YDL197C	1578 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YHR182W	YHR182W	2358 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	DSF1	YEL070W	1509 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YNR073C	YNR073C	1509 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	RAD24	YER173W	1980 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	SEC9	YGR009C	1956 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	PMP3	YDR276C	168 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YER186C	YER186C	921 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	ECT1	YGR007W	972 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	PHB1	YGR132C	864 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YNL285W	YNL285W	372 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	HSP78	YDR258C	2436 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YMR027W	YMR027W	1413 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	ATP1	YBL099W	1638 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	NUD1	YOR373W	2556 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	URA3	YEL021W	804 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YER148W-A	YER148W-A	579 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	PDE1	YGL248W	1110 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	MED6	YHR058C	888 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	TAL1	YLR354C	1008 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	JNM1	YMR294W	1122 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	FSF1	YOR271C	984 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YPL062W	YPL062W	405 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	COX11	YPL132W	903 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	UTP18	YJL069C	1785 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	PKC1	YBL105C	3456 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	YPK2	YMR104C	2034 nt		4.46	□□□□□ -1.69
VAR1	P02381	RPS2	YGL123W	765 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	PRS1	YKL181W	1284 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	RNH201	YNL072W	924 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	BPL1	YDL141W	2073 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	PDR10	YOR328W	4695 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YEL077C	YEL077C	3834 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	OPT1	YJL212C	2400 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	NOC4	YPR144C	1659 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YHL018W	YHL018W	363 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	SUP19	tS(UGA)E	82 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	SUP17	tS(UGA)I	82 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	SUP16	tS(UGA)P	82 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	DJP1	YIR004W	1299 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	RPS5	YJR123W	678 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	CIN4	YMR138W	576 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YNL042W-B	YNL042W-B	258 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	SIA1	YOR137C	1869 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	DIA3	YDL024C	1407 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	ADE6	YGR061C	4077 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	TFC6	YDR362C	2019 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	DEF1	YKL054C	2217 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YDL129W	YDL129W	876 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	RPT6	YGL048C	1218 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	RME1	YGR044C	903 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YKL107W	YKL107W	930 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	PFA3	YNL326C	1011 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	SNZ2	YNL333W	897 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	VMA13	YPR036W	1437 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	ASK10	YGR097W	3441 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	GIT1	YCR098C	1557 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	SPC97	YHR172W	2472 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YEL075W-A	YEL075W-A	612 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YFR035C	YFR035C	345 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YLR463C	YLR463C	552 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YML018C	YML018C	1182 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	PRP43	YGL120C	2304 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	LEU5	YHR002W	1074 nt		4.42	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 117.4 ms