Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPLO60437 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PPLO60437 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPLO60437 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPLO60437 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPLO60437 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPLO60437 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPLO60437 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPLO60437 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPLO60437 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPLO60437 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PPLO60437 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PPLO60437 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PPLO60437 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPLO60437 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPLO60437 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPLO60437 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPLO60437 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPLO60437 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPLO60437 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPLO60437 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPLO60437 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPLO60437 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPLO60437 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPLO60437 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPLO60437 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPLO60437 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPLO60437 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPLO60437 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PPLO60437 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPLO60437 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPLO60437 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPLO60437 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPLO60437 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPLO60437 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPLO60437 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PPLO60437 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPLO60437 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPLO60437 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPLO60437 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPLO60437 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PPLO60437 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPLO60437 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPLO60437 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPLO60437 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPLO60437 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPLO60437 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPLO60437 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPLO60437 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PPLO60437 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPLO60437 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPLO60437 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPLO60437 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPLO60437 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPLO60437 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPLO60437 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PPLO60437 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPLO60437 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPLO60437 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PPLO60437 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPLO60437 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPLO60437 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPLO60437 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPLO60437 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPLO60437 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PPLO60437 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPLO60437 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PPLO60437 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPLO60437 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPLO60437 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPLO60437 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPLO60437 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PPLO60437 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PPLO60437 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPLO60437 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPLO60437 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPLO60437 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPLO60437 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPLO60437 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PPLO60437 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PPLO60437 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PPLO60437 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PPLO60437 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PPLO60437 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PPLO60437 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
PPLO60437 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PPLO60437 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PPLO60437 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PPLO60437 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PPLO60437 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PPLO60437 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms