Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKNO60260 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKNO60260 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKNO60260 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKNO60260 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKNO60260 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKNO60260 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKNO60260 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKNO60260 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKNO60260 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKNO60260 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKNO60260 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKNO60260 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKNO60260 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKNO60260 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKNO60260 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKNO60260 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKNO60260 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKNO60260 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKNO60260 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKNO60260 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKNO60260 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKNO60260 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKNO60260 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKNO60260 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKNO60260 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKNO60260 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKNO60260 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKNO60260 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKNO60260 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKNO60260 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKNO60260 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKNO60260 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKNO60260 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKNO60260 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKNO60260 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKNO60260 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKNO60260 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKNO60260 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKNO60260 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKNO60260 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKNO60260 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKNO60260 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKNO60260 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKNO60260 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKNO60260 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKNO60260 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKNO60260 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKNO60260 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKNO60260 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKNO60260 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKNO60260 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKNO60260 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKNO60260 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKNO60260 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKNO60260 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKNO60260 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKNO60260 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKNO60260 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKNO60260 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKNO60260 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKNO60260 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKNO60260 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKNO60260 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKNO60260 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKNO60260 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKNO60260 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKNO60260 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKNO60260 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKNO60260 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKNO60260 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKNO60260 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKNO60260 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKNO60260 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKNO60260 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKNO60260 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKNO60260 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKNO60260 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKNO60260 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKNO60260 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms