Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAFD1O14545 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAFD1O14545 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
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