Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL33A6NCF5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms