Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID1Q9ULK0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRID1Q9ULK0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms