Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms