Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3BQ9P1U1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms