Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNK4Q9NYG8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNK4Q9NYG8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms