Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MS4A12Q9NXJ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms