Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MID1IP1Q9NPA3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms