Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA1Q9NP55 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BPIFA1Q9NP55 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms