Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSS3Q9H6R3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSS3Q9H6R3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms