Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MESP1Q9BRJ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms