Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms