Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2E2Q96LR5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms