Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00208Q96KT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms