Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms