Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC107Q8WV48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms