Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPRYD3Q8NCJ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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