Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SVBPQ8N300 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms