Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYDE1Q6ZW31 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYDE1Q6ZW31 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms