Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGAP27Q6ZUM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms