Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf50Q5SZB4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf50Q5SZB4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf50Q5SZB4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf50Q5SZB4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf50Q5SZB4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf50Q5SZB4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C9orf50Q5SZB4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf50Q5SZB4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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