Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHL40Q2TBA0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL40Q2TBA0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms