Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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LAPTM4AQ15012 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAPTM4AQ15012 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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LAPTM4AQ15012 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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LAPTM4AQ15012 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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