Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 ICL1YER065C 1674 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 YLL067CYLL067C 3618 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 SGE1YPR198W 1632 nt5.81□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 MKC7YDR144C 1791 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 VMS1YDR049W 1899 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 WHI2YOR043W 1461 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 YDR278CYDR278C 318 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 PCL6YER059W 1263 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 TSA1YML028W 591 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 MTF1YMR228W 1026 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 DDC1YPL194W 1839 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 GIT1YCR098C 1557 nt5.8□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 GPI11YDR302W 660 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 BCY1YIL033C 1251 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 PML1YLR016C 615 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 MRPS16YPL013C 366 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 SVF1YDR346C 1446 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 SRV2YNL138W 1581 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 UTP4YDR324C 2331 nt5.79□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 AVO1YOL078W 3531 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 GUD1YDL238C 1470 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 QRI5YLR204W 336 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 YNR068CYNR068C 819 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 HXT17YNR072W 1695 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 GPB2YAL056W 2643 nt5.78□□□□□ -1.48
TY2A-OR1Q12439 UTP6YDR449C 1323 nt5.77□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 PCL10YGL134W 1302 nt5.77□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 HST3YOR025W 1344 nt5.77□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 RPT3YDR394W 1287 nt5.77□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 YEL068CYEL068C 333 nt5.77□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 BUR6YER159C 429 nt5.77□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 LYS12YIL094C 1116 nt5.77□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 AIM41YOR215C 558 nt5.77□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 PYC2YBR218C 3543 nt5.77□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 CLD1YGR110W 1338 nt5.76□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 YUR1YJL139C 1287 nt5.76□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 TAF4YMR005W 1167 nt5.76□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 DAP1YPL170W 459 nt5.76□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 YDR387CYDR387C 1668 nt5.75□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 MDM31YHR194W 1740 nt5.75□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 AAD6YFL056C 639 nt5.75□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 DOT5YIL010W 648 nt5.75□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 PRE3YJL001W 648 nt5.75□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 RPS5YJR123W 678 nt5.75□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 HAP3YBL021C 435 nt5.75□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 JNM1YMR294W 1122 nt5.75□□□□□ -1.49
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TY2A-OR1Q12439 YPR114WYPR114W 948 nt5.75□□□□□ -1.49
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TY2A-OR1Q12439 SPO77YLR341W 1434 nt5.74□□□□□ -1.49
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TY2A-OR1Q12439 AVT4YNL101W 2142 nt5.73□□□□□ -1.49
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TY2A-OR1Q12439 KKQ8YKL168C 2175 nt5.73□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 ISC1YER019W 1434 nt5.73□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 YLH47YPR125W 1365 nt5.72□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 UTP9YHR196W 1728 nt5.72□□□□□ -1.49
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TY2A-OR1Q12439 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.72□□□□□ -1.49
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TY2A-OR1Q12439 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.72□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.72□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.72□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 SNN1YNL086W 309 nt5.72□□□□□ -1.49
TY2A-OR1Q12439 YOL035CYOL035C 303 nt5.72□□□□□ -1.49
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TY2A-OR1Q12439 VRP1YLR337C 2454 nt5.72□□□□□ -1.49
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TY2A-OR1Q12439 CIN4YMR138W 576 nt5.7□□□□□ -1.5
TY2A-OR1Q12439 OSW5YMR148W 447 nt5.7□□□□□ -1.5
TY2A-OR1Q12439 ATG4YNL223W 1485 nt5.7□□□□□ -1.5
TY2A-OR1Q12439 HXT2YMR011W 1626 nt5.7□□□□□ -1.5
TY2A-OR1Q12439 TPO3YPR156C 1869 nt5.69□□□□□ -1.5
TY2A-OR1Q12439 YHL017WYHL017W 1599 nt5.69□□□□□ -1.5
TY2A-OR1Q12439 SPG1YGR236C 288 nt5.69□□□□□ -1.5
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TY2A-OR1Q12439 PEX32YBR168W 1242 nt5.69□□□□□ -1.5
TY2A-OR1Q12439 MNN5YJL186W 1761 nt5.69□□□□□ -1.5
TY2A-OR1Q12439 RAD24YER173W 1980 nt5.69□□□□□ -1.5
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