Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 APN1YKL114C 1104 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 YML083CYML083C 1257 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 KTR1YOR099W 1182 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 PZF1YPR186C 1290 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 ECM31YBR176W 939 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 APM4YOL062C 1476 nt5.9□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 SNF11YDR073W 510 nt5.9□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 SNZ3YFL059W 897 nt5.9□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 YIR042CYIR042C 711 nt5.9□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 LCB3YJL134W 1230 nt5.9□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 MEH1YKR007W 555 nt5.9□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.9□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 AAD14YNL331C 1131 nt5.9□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 PPR1YLR014C 2715 nt5.9□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 TRP3YKL211C 1455 nt5.9□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 ATG18YFR021W 1503 nt5.89□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 GPD1YDL022W 1176 nt5.89□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 MRPL35YDR322W 1104 nt5.89□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 SRL2YLR082C 1179 nt5.89□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 MSO1YNR049C 633 nt5.89□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 YPR123CYPR123C 435 nt5.89□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 UBA2YDR390C 1911 nt5.89□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 ERG1YGR175C 1491 nt5.89□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 PLB3YOL011W 2061 nt5.89□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 VNX1YNL321W 2727 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 URA1YKL216W 945 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 TAF9YMR236W 474 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 GTO3YMR251W 1101 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 COS10YNR075W 1125 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 CKA2YOR061W 1020 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 PTC4YBR125C 1182 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 SIP5YMR140W 1470 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 ATE1YGL017W 1512 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 NSI1YDR026C 1713 nt5.88□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 ADK2YER170W 678 nt5.87□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 TMT1YER175C 900 nt5.87□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 GPD2YOL059W 1323 nt5.87□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 PPT1YGR123C 1542 nt5.87□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 SAL1YNL083W 1485 nt5.86□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 YDR278CYDR278C 318 nt5.86□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 YGL185CYGL185C 1140 nt5.86□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 POP5YAL033W 522 nt5.86□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 RPL21AYBR191W 483 nt5.86□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 NUP1YOR098C 3231 nt5.86□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 TBF1YPL128C 1689 nt5.85□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 GRX4YER174C 735 nt5.85□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 YJR085CYJR085C 318 nt5.85□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 PUS4YNL292W 1212 nt5.85□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 PSE1YMR308C 3270 nt5.85□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 DPH2YKL191W 1605 nt5.85□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 PTC3YBL056W 1407 nt5.84□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 YKR045CYKR045C 552 nt5.84□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 MRPS18YNL306W 654 nt5.84□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 AMD2YDR242W 1650 nt5.84□□□□□ -1.47
NFI1Q12216 YHR182WYHR182W 2358 nt5.84□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 MHT1YLL062C 975 nt5.83□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 SNZ2YNL333W 897 nt5.83□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 COX11YPL132W 903 nt5.83□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 QRI1YDL103C 1434 nt5.82□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 YLH47YPR125W 1365 nt5.82□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 GCG1YER163C 699 nt5.82□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 OM45YIL136W 1182 nt5.82□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 HXT5YHR096C 1779 nt5.82□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 PIF1YML061C 2580 nt5.82□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 YTP1YNL237W 1380 nt5.81□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 ABZ1YNR033W 2364 nt5.81□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 FRE3YOR381W 2136 nt5.81□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 RET1YOR207C 3450 nt5.81□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 VCX1YDL128W 1236 nt5.81□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 YMC1YPR058W 924 nt5.81□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 SPC97YHR172W 2472 nt5.81□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 FHL1YPR104C 2811 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 ASK10YGR097W 3441 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 EXG1YLR300W 1347 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 BUG1YDL099W 1026 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 YGL235WYGL235W 537 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 TSR2YLR435W 618 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 SPG4YMR107W 348 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 SWP1YMR149W 861 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 ILV6YCL009C 930 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 ASF2YDL197C 1578 nt5.8□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 PEX19YDL065C 1029 nt5.79□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.79□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 MRS1YIR021W 1092 nt5.79□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 ERG8YMR220W 1356 nt5.79□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 MCH1YDL054C 1461 nt5.78□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 PRS1YKL181W 1284 nt5.78□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 FPR3YML074C 1236 nt5.78□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 DAP1YPL170W 459 nt5.78□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 SEC39YLR440C 2130 nt5.78□□□□□ -1.48
NFI1Q12216 RFA1YAR007C 1866 nt5.77□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 ILV1YER086W 1731 nt5.77□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 CBT1YKL208W 816 nt5.77□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 RPS3YNL178W 723 nt5.77□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 PPG1YNR032W 1107 nt5.77□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 CTS2YDR371W 1536 nt5.77□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 CNE1YAL058W 1509 nt5.77□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 STE20YHL007C 2820 nt5.77□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 ATP1YBL099W 1638 nt5.77□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 HIR1YBL008W 2523 nt5.77□□□□□ -1.49
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