Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.59□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 RRT2YBR246W 1164 nt5.59□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 DDC1YPL194W 1839 nt5.59□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 ICL1YER065C 1674 nt5.59□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 RFA1YAR007C 1866 nt5.58□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 IMG1YCR046C 510 nt5.58□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YDL218WYDL218W 954 nt5.58□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YDR396WYDR396W 501 nt5.58□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 NCS6YGL211W 1080 nt5.58□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 HOR7YMR251W-A 180 nt5.58□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 RAD24YER173W 1980 nt5.58□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 GYP1YOR070C 1914 nt5.58□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YIR007WYIR007W 2295 nt5.57□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 SNZ3YFL059W 897 nt5.57□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 LYS12YIL094C 1116 nt5.57□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 GFD1YMR255W 567 nt5.57□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 SNZ2YNL333W 897 nt5.57□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 GPT2YKR067W 2232 nt5.56□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 TIM22YDL217C 624 nt5.56□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YIL060WYIL060W 435 nt5.56□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 NPA3YJR072C 1158 nt5.56□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 COX17YLL009C 210 nt5.56□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YLR296WYLR296W 327 nt5.56□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 PSH1YOL054W 1221 nt5.56□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 MLC2YPR188C 492 nt5.56□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 VTC2YFL004W 2487 nt5.56□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 BNA5YLR231C 1362 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 MNN2YBR015C 1794 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 UTP9YHR196W 1728 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 HEM3YDL205C 984 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 PHB1YGR132C 864 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 DJP1YIR004W 1299 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 RBD2YPL246C 789 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 GEX1YCL073C 1848 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 GEX2YKR106W 1848 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 GUP2YPL189W 1830 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 DBP9YLR276C 1785 nt5.55□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 AAP1YHR047C 2571 nt5.54□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.54□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 SFC1YJR095W 969 nt5.54□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YMR252CYMR252C 405 nt5.54□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YBL112CYBL112C 318 nt5.54□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 CPA1YOR303W 1236 nt5.54□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YEL077CYEL077C 3834 nt5.54□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 VNX1YNL321W 2727 nt5.54□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 RHO4YKR055W 876 nt5.53□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 YMR122CYMR122C 375 nt5.53□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 SEC17YBL050W 879 nt5.53□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 CAF40YNL288W 1122 nt5.53□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 TSR3YOR006C 942 nt5.53□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 ERI1YPL096C-A 207 nt5.53□□□□□ -1.52
YMR226CQ05016 UGX2YDL169C 672 nt5.52□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YDR053WYDR053W 396 nt5.52□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 MPM1YJL066C 759 nt5.52□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YJL171CYJL171C 1191 nt5.52□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YKL031WYKL031W 414 nt5.52□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 SRY1YKL218C 981 nt5.52□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YPR098CYPR098C 486 nt5.52□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 CDC1YDR182W 1476 nt5.51□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 SCT1YBL011W 2280 nt5.51□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YDR109CYDR109C 2148 nt5.51□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 STE13YOR219C 2796 nt5.51□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 APN1YKL114C 1104 nt5.51□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 SIT1YEL065W 1887 nt5.51□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 DEF1YKL054C 2217 nt5.51□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YML082WYML082W 1950 nt5.51□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 ERG1YGR175C 1491 nt5.51□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 SEC12YNR026C 1416 nt5.5□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 ABZ1YNR033W 2364 nt5.5□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YMR155WYMR155W 1644 nt5.5□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 APE3YBR286W 1614 nt5.5□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 PDB1YBR221C 1101 nt5.5□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YAP1801YHR161C 1914 nt5.5□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 ASF2YDL197C 1578 nt5.5□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 HPF1YOL155C 2904 nt5.5□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 SIA1YOR137C 1869 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 TEL2YGR099W 2067 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 OSW2YLR054C 2175 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 FAT3YKL187C 2253 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YDR015CYDR015C 240 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 MSP1YGR028W 1089 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 JNM1YMR294W 1122 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YNL285WYNL285W 372 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YBR124WYBR124W 360 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 PDC1YLR044C 1692 nt5.49□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 LEU5YHR002W 1074 nt5.48□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YJL193WYJL193W 1209 nt5.48□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 YMR295CYMR295C 594 nt5.48□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 ROG3YFR022W 2202 nt5.48□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 AMD1YML035C 2433 nt5.47□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 TFG2YGR005C 1203 nt5.47□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 PGA2YNL149C 390 nt5.47□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 RGT1YKL038W 3513 nt5.47□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 HAP1YLR256W 4509 nt5.47□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 VRP1YLR337C 2454 nt5.47□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 RBA50YDR527W 1320 nt5.47□□□□□ -1.53
YMR226CQ05016 ISN1YOR155C 1353 nt5.46□□□□□ -1.54
YMR226CQ05016 YDL129WYDL129W 876 nt5.46□□□□□ -1.54
YMR226CQ05016 YER010CYER010C 705 nt5.46□□□□□ -1.54
YMR226CQ05016 HVG1YER039C 750 nt5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.1 ms