Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLOD1Q02809 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms