Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 SCP1YOR367W 603 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 DAP1YPL170W 459 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 TAH18YPR048W 1872 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 COR1YBL045C 1374 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YAP1801YHR161C 1914 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YLL067CYLL067C 3618 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 HRQ1YDR291W 3234 nt5.77□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 MDH3YDL078C 1032 nt5.77□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YKL077WYKL077W 1179 nt5.77□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 BSC5YNR069C 1470 nt5.77□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 UPS3YDR185C 540 nt5.76□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 GAL83YER027C 1254 nt5.76□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 AIM20YIL158W 615 nt5.76□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 RPL10YLR075W 666 nt5.76□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.76□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 MRPL23YOR150W 492 nt5.76□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 CDS1YBR029C 1374 nt5.76□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 FAT3YKL187C 2253 nt5.76□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 GUA1YMR217W 1578 nt5.76□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 VNX1YNL321W 2727 nt5.75□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 GPD1YDL022W 1176 nt5.75□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 RPL12AYEL054C 498 nt5.75□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YRB2YIL063C 984 nt5.75□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YKL107WYKL107W 930 nt5.75□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 MED4YOR174W 855 nt5.75□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YMC1YPR058W 924 nt5.75□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 ISN1YOR155C 1353 nt5.75□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 VCX1YDL128W 1236 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 COX20YDR231C 618 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 OPI7YDR360W 435 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 TMT1YER175C 900 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 PDE1YGL248W 1110 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 CTF19YPL018W 1110 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 ERI1YPL096C-A 207 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 MNN2YBR015C 1794 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 ARE2YNR019W 1929 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 CTS2YDR371W 1536 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 UGO1YDR470C 1509 nt5.74□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 UBX2YML013W 1755 nt5.73□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 UBA1YKL210W 3075 nt5.73□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.73□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.73□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.73□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YKL153WYKL153W 510 nt5.73□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 RNH1YMR234W 1047 nt5.73□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 CRH1YGR189C 1524 nt5.73□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YEF1YEL041W 1488 nt5.72□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 RGT1YKL038W 3513 nt5.72□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.72□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 ASF1YJL115W 840 nt5.72□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 YAR064WYAR064W 300 nt5.72□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 SCS22YBL091C-A 528 nt5.72□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 EXG1YLR300W 1347 nt5.72□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 SRV2YNL138W 1581 nt5.72□□□□□ -1.49
CIK1Q01649 ASP1YDR321W 1146 nt5.71□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 RPT3YDR394W 1287 nt5.71□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 FMO1YHR176W 1299 nt5.71□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 PFA3YNL326C 1011 nt5.71□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 ERG7YHR072W 2196 nt5.71□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 VBA1YMR088C 1689 nt5.71□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 FLC3YGL139W 2409 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 GAT1YFL021W 1533 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 MRPL35YDR322W 1104 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 ERC1YHR032W 1746 nt5.7□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 RPN11YFR004W 921 nt5.69□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 LCL3YGL085W 825 nt5.69□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 YLR184WYLR184W 348 nt5.69□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 MTF1YMR228W 1026 nt5.69□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 ATP1YBL099W 1638 nt5.69□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 RTT103YDR289C 1230 nt5.68□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.68□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 TAF11YML015C 1041 nt5.68□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 YBL112CYBL112C 318 nt5.68□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 RPN7YPR108W 1290 nt5.68□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 SAL1YNL083W 1485 nt5.68□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 ASH1YKL185W 1767 nt5.67□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 YKL102CYKL102C 306 nt5.67□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 TAL1YLR354C 1008 nt5.67□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 TAF9YMR236W 474 nt5.67□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 LSC1YOR142W 990 nt5.67□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 FSF1YOR271C 984 nt5.67□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 ABZ1YNR033W 2364 nt5.67□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 YTP1YNL237W 1380 nt5.67□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 RFA1YAR007C 1866 nt5.66□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 APE1YKL103C 1545 nt5.66□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 RPS16BYDL083C 432 nt5.66□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 YEA6YEL006W 1008 nt5.66□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 MDH1YKL085W 1005 nt5.66□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.66□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 MRPS18YNL306W 654 nt5.66□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 RFA2YNL312W 822 nt5.66□□□□□ -1.5
CIK1Q01649 YNR040WYNR040W 771 nt5.66□□□□□ -1.5
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