Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFAMQ00059 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFAMQ00059 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms