Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP54P61011 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP54P61011 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP54P61011 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP54P61011 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP54P61011 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP54P61011 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP54P61011 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP54P61011 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP54P61011 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP54P61011 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP54P61011 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP54P61011 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP54P61011 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP54P61011 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP54P61011 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP54P61011 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP54P61011 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP54P61011 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRP54P61011 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP54P61011 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP54P61011 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP54P61011 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP54P61011 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP54P61011 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP54P61011 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP54P61011 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP54P61011 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP54P61011 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP54P61011 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP54P61011 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP54P61011 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP54P61011 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP54P61011 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP54P61011 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP54P61011 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP54P61011 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP54P61011 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP54P61011 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP54P61011 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP54P61011 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP54P61011 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP54P61011 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP54P61011 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP54P61011 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP54P61011 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP54P61011 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP54P61011 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP54P61011 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP54P61011 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP54P61011 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP54P61011 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP54P61011 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP54P61011 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP54P61011 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP54P61011 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP54P61011 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP54P61011 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP54P61011 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP54P61011 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP54P61011 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP54P61011 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP54P61011 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP54P61011 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP54P61011 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP54P61011 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRP54P61011 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRP54P61011 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP54P61011 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP54P61011 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP54P61011 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP54P61011 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP54P61011 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP54P61011 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP54P61011 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP54P61011 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP54P61011 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP54P61011 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms