Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMD4P55036 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms