Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1P48651 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1P48651 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1P48651 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1P48651 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1P48651 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1P48651 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1P48651 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1P48651 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1P48651 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1P48651 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTDSS1P48651 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1047.8 ms