Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSOP43234 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSOP43234 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSOP43234 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSOP43234 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSOP43234 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSOP43234 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSOP43234 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSOP43234 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSOP43234 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSOP43234 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSOP43234 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTSOP43234 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSOP43234 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSOP43234 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSOP43234 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSOP43234 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSOP43234 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSOP43234 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSOP43234 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSOP43234 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSOP43234 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSOP43234 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSOP43234 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSOP43234 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSOP43234 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSOP43234 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSOP43234 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSOP43234 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSOP43234 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSOP43234 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSOP43234 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSOP43234 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSOP43234 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSOP43234 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSOP43234 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSOP43234 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSOP43234 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSOP43234 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSOP43234 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSOP43234 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSOP43234 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSOP43234 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSOP43234 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSOP43234 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSOP43234 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSOP43234 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSOP43234 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSOP43234 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSOP43234 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSOP43234 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSOP43234 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSOP43234 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSOP43234 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSOP43234 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSOP43234 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSOP43234 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSOP43234 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSOP43234 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSOP43234 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSOP43234 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSOP43234 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSOP43234 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSOP43234 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSOP43234 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSOP43234 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSOP43234 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSOP43234 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSOP43234 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSOP43234 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSOP43234 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSOP43234 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSOP43234 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSOP43234 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSOP43234 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSOP43234 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSOP43234 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSOP43234 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSOP43234 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms