Protein–RNA interactions for Protein: P01848

TRAC, T-cell receptor alpha chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRACP01848 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRACP01848 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRACP01848 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRACP01848 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRACP01848 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRACP01848 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRACP01848 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRACP01848 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRACP01848 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRACP01848 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRACP01848 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRACP01848 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRACP01848 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRACP01848 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRACP01848 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRACP01848 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRACP01848 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRACP01848 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRACP01848 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRACP01848 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRACP01848 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms