Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC22O60826 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC22O60826 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms