Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1AO60341 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1AO60341 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM1AO60341 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM1AO60341 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM1AO60341 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms