Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TP73O15350 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TP73O15350 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TP73O15350 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TP73O15350 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TP73O15350 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP73O15350 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TP73O15350 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP73O15350 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP73O15350 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP73O15350 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP73O15350 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP73O15350 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP73O15350 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP73O15350 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP73O15350 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP73O15350 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP73O15350 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP73O15350 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP73O15350 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP73O15350 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TP73O15350 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TP73O15350 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP73O15350 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP73O15350 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP73O15350 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP73O15350 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TP73O15350 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP73O15350 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP73O15350 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP73O15350 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP73O15350 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP73O15350 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP73O15350 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP73O15350 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP73O15350 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP73O15350 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP73O15350 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP73O15350 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP73O15350 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP73O15350 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP73O15350 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP73O15350 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP73O15350 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP73O15350 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP73O15350 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP73O15350 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP73O15350 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP73O15350 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP73O15350 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP73O15350 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP73O15350 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP73O15350 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP73O15350 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP73O15350 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP73O15350 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP73O15350 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP73O15350 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP73O15350 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP73O15350 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP73O15350 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP73O15350 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP73O15350 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP73O15350 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP73O15350 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP73O15350 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP73O15350 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP73O15350 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP73O15350 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP73O15350 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP73O15350 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP73O15350 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP73O15350 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms