Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN7AO14910 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN7AO14910 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN7AO14910 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN7AO14910 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN7AO14910 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIN7AO14910 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIN7AO14910 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN7AO14910 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN7AO14910 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN7AO14910 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN7AO14910 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN7AO14910 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN7AO14910 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN7AO14910 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN7AO14910 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN7AO14910 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms